Národní přírodní památka se zpravidla nachází na území menší rozlohy (maximálně několik hektarů). Cílem ochrany je zachování většinou jen jednoho přírodního objektu jako například geologického útvaru (jeskyně, geologický profil), mineralogického naleziště, lokality s výskytem vzácných a ohrožených druhů, nebo také útvaru vysoké estetické hodnoty vytvořeného člověkem (historicky cenné parkové úpravy krajiny, arboreta apod.). NPP vyhlašuje obecně závazným předpisem Ministerstvo životního prostředí. Národní přírodní památka v biosférické rezervaci je vyhlášena na území:

• Dunajovické kopce – porosty nízkých suchomilných křovin a stepních trávníků
• Kalendář věků – světová geologická a archeologická lokalita
• Pastvisko u Lednice – mokřadní ekosystém a důležité hnízdiště vodních ptáků
• Rendezvous – teplomilné lesní porosty na píscích a mykologická lokalita