Na území biosférické rezervace se nachází Chráněná krajinná oblast Pálava, vyhlášena v roce 1976 a s rozlohou 83 km2 se řadí k nejmenším chráněným oblastem ČR. Druhová skladba rostlin a živočichů žijících na území je velmi pestrá. Přírodní podmínky oblasti umožnily výskyt mnoha druhů rostlin, které jinde v ČR nerostou. Na území lze najít suché skalní trávníky, suchomilné křoviny a teplomilné doubravy, sprašové doubravy s druhově bohatým bylinným podrostem nebo panonské dubohabřiny. Pod úpatím vápencového bradla Pavlovských vrchů, v nivě Dyje, zůstaly zachovány, kromě několika nevelkých zaplavovaných lužních luk, porosty tvrdého luhu s dubem letním a jasanem úzkolistým. V jižní části, na březích rybníka Nesyt, se vyskytují zbytky slanomilné vegetace. V Chráněné krajinné oblasti Pálava jsou čtyři národní přírodní rezervace, jedna národní přírodní památka, pět přírodních rezervací a čtyři přírodní památky.