První biosférické rezervace začaly vznikat koncem 70. let minulého století. V ČR je v současnosti šest biosférických rezervací: Křivoklátsko, Třeboňsko, Šumava, Krkonoše, Bílé Karpaty a Biosférický rezervace Dolní Morava. Poslední jmenována biosférická rezervace není jako jediná shodná s žádným chráněným územím a je spravována obecně prospěšnou společností s účastí zainteresovaných subjektů a obcí. Ostatních pět je řízeno státními orgány ochrany přírody a májí území shodné s některým zvláště chráněným územím. Do roku 2017 byl garantem Programu MAB a biosférických rezervací v ČR Český národní komitét MaB v rámci Akademie věd ČR. Ta však tento komitét zrušila a Rada pro zahraniční styky AV ČR požádala o formální převedení agendy Programu MAB pod Ministerstvo životního prostředí ČR, které zatím žádné oficiální kroky neučinilo. Od roku 2018 není Program MAB v ČR oficiálně nijak koordinován.